МОРФОЛОГИЧЕСКИЕ И ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ КЫРГЫЗСКИХ ЛОШАДЕЙ
DOI:
https://doi.org/10.52754/16948696_2025_2(11)_4Ключевые слова:
экстерьер, SNP-генотипирование, маркеры, полиморфизм, статистический анализ, кластерный анализАннотация
Актуальность исследования обусловлена необходимостью сохранения и селекционного совершенствования аборигенной кыргызской лошади – редкой и уникальной породной группы, приспособленной к экстремальным условиям высокогорья. При этом генетические характеристики данной популяции ранее были изучены крайне ограниченно, что затрудняет эффективное управление её генофондом. Целью настоящей работы было установление внутрипопуляционной генетической структуры кыргызских лошадей северо-восточного региона Кыргызской Республики с использованием однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) и морфологических показателей. Для достижения цели использовались методы SNP-генотипирования с применением массива Equine80k (Illumina), морфометрические измерения экстерьера, кластерный и корреляционный анализы (UPGMA, PCoA, Dice, Mantel), а также бинарное кодирование фенотипических данных. По данным SNP-анализа вся выборка была разделена на два кластера: в первом – 22 лошади с генетически однородной структурой, во втором – 3 особи (KIR8, KIR18, KIR20) с повышенной генетической дистанцией. По морфологическим признакам также выделены два кластера: первый включал особей преимущественно тёмных мастей (92 %) с телосложением ниже средних стандартов (до 136 см в холке у 83 %), второй – особей светлых мастей (рыжая, серая, игреневая, 83 %) с развитыми экстерьерными показателями (высота в холке >136 см, грудь >158 см – у 92 %, пясть >18 см – у 100 %). Однако результаты вариационного анализа и теста Манте́ля (r = -0,07396; p = 0,0499) показали отсутствие статистически значимой связи между морфологическими признаками и SNP-данными. Это свидетельствует о независимости традиционных экстерьерных характеристик от используемых молекулярных маркеров. Практическое значение исследования заключается в формировании базы для будущей селекционной работы и DNA-паспортизации кыргызских лошадей, а также в разработке генетически обоснованных программ по сохранению аборигенных популяций в условиях горного животноводства
Библиографические ссылки
Ayala-Valdovinos, M.A., Galindo-García, J., Sánchez-Chiprés, D., & Duifhuis-Rivera, T. (2016). New test for endothelin receptor type B (EDNRB) mutation genotyping in horses. Molecular and Cellular Probes, 30(3), 182-184. doi: 10.1016/j.mcp.2016.03.005.
Dice, L.R. (1945). Measures of the amount of ecologic association between species. Ecology, 26(3), 297-302. doi: 10.2307/1932409.
Eurasian Economic Commission, Collegium (Decision No. 74). (2020, June).Retrieved fromhttps://eec.eaeunion.org/upload/medialibrary/f97/vpx2huc8kzx9abkm727o2xflt2lq2k84/OBSHCH AYA-INFORMATSIYA-plemennoe-zhivotnovodstvo.pdf.
European Convention for the Protection of Vertebrate Animals used for Experimental and other Scientific Purposes (ETS No. 123). (1986, March). Retrieved from https://www.coe.int/en/web/conventions/full-list?module=treaty-detail&treatynum=123.
Genetic structure and genome-wide association study of the traditional Kazakh horses. (n.d.). Retrieved from https://madbarn.com/research/genetic-structure-and-genome-wide-association-study-of-the-traditional-kazakh-horses/.
Gómez, M.D., Sánchez, M.J., Bartolomé, E., Cervantes, I., Poyato-Bonilla, J., Demyda-Peyrás, S., & Valera, M. (2020). Phenotypic and genetic analysis of reproductive traits in horse populations with different breeding purposes. Animal, 14(7), 1351-1361. doi: 10.1017/S1751731120000087.
International Society for Animal Genetics (ISAG). (2017) Retrieved from https://www.isag.us/committees.asp.
Isakova, J., Isayev, M.A., Kipen, V., Kalinkova, L., Kalinkova, L.V., Aitbaev, K.A., Arzybaev, M.A., Mukeeva, S.B., Meerym, O.K., & Aldasheva, N.M. (2021). Phylogenetic analysis for the Kirghiz horse breed by 17 microsatellite markers – an extended research. Horse Breeding and Equestrian Sports, 1, 23-26.
Isakova, J., Toktosunov, B.I., Kipen, V., Kalinkova, L., Talaybekova, E.T., Aldasheva, N.M., & Abdurasulov, A. (2018). Genetic portrait of Kyrgyz horse. Retrieved from https://www.researchgate.net/publication/332708229_GENETIC_PORTRAIT_OF_KYRGYZ_HORSE_GENETICESKIJ_PORTRET_KYRGYZSKOJ_LOSADI.
Kabylbekova, D., Ussenbekov, Y., Assanbayev, T., Bekmanov, B., & Kassymbekova, Sh. (2023). Identification on SNP polymorphisms associated with meat productivity in the local Kazakh horse breed. Fundamental and Experimental Biology, 4(112), 69-76. doi: 10.31489/2023bmg4/69-76.
Kristjansson, T., Bjornsdottir, S., Sigurdsson, A., Andersson, L.S., Lindgren, G., Helyar, S.J., Klonowski, A.M., & Arnason, T. (2014). The effect of the “Gait keeper” mutation in the DMRT3 gene on gaiting ability in Icelandic horses. Journal of Animal Breeding and Genetics, 131(6), 415-425. doi: 10.1111/jbg.12112.
Mantel, N. (1967). The detection of disease clustering and a generalized regression approach. Cancer Research, 27(2), 209-220.
Metzger, J., Tonda, R., Beltran, S., Águeda, L., Gut, M., & Distl, O. (2014). Next generation sequencing gives an insight into the characteristics of highly selected breeds versus non-breed horses in the course of domestication. BMC Genomics, 15, article number 562. doi: 10.1186/1471-2164-15-562.
Omurzakov, S.D. (2011). Heritability of economically useful traits in Novo-Kyrgyz horses. Bulletin of Agricultural Science, (4), 37-41.
Page, R.D.M. (1996). Tree View: An application to display phylogenetic trees on personal computers, Bioinformatics, 12(4), 357-358. doi: 10.1093/bioinformatics/12.4.357.
Pavlíček, A., Hrdá, S., & Flegr, J. (1999). Free-Tree – freeware program for construction of phylogenetic trees on the basis of distance data and bootstrap/jackknife analysis of the tree robustness: Application in the RAPD analysis of genus Frenkelia. Folia Biologica, 45(3), 97-99.
Pozharskiy, A., et al. (2023). Gritsenko Genetic structure and genome-wise association study of traditional Kazakh horses. BioRxiv. doi: 10.1101/2023.03.29.534422.
Rohlf, F.J. (1998). NTSYSpc numerical taxonomy and multivariate analysis system. New York: Department of Ecology and Evolution State University of New York Stony Brook.
Rossokha, V., Boyko, O., Tur, G., Zaderikhina, O., Brovko, O., & Oliinychenko, Y. (2022). Genetic analysis of local Ukrainian horse breeds by polymorphisms in LY49B, EDNRB and CSN3 genes. Animal Breeding and Genetics, 127, 42-49. doi: 10.32900/2312-8402-2022-127-42-49.
Todd, E.T., Thomson, P.C., Hamilton, N.A., Ang, R.A., Lindgren, G., Viklund, Å., Eriksson, S., Mikko, S., Strand, E., & Velie, B.D. (2020). A genome-wide scan for candidate lethal variants in Thoroughbred horses. Scientific Reports, 10, article number 13153. doi: 10.1038/s41598-020-68946-8.
Tozaki, T., et al. (2019). Genetic diversity and relationships among native Japanese horse breeds, the Japanese Thoroughbred and horses outside of Japan using genome-wide SNP data. Animal Genetics, 50(5), 449-459. doi: 10.1111/age.12819.
World Organisation for Animal Health (OIE). (2021). Retrieved from https://www.woah.org/app/uploads/2021/06/a-88sg-final-report-2021.pdf.
Yun, J., Oyungerel, B., & Kong, H.S. (2022). Genetic diversity and population structure of Mongolian regional horses with 14 microsatellite markers. Animal Bioscience, 35(8), 1121-1128. doi: 10.5713/ab.21.0497.
Загрузки
Опубликован
Как цитировать
Выпуск
Раздел
Лицензия
Copyright (c) 2025 Болот Токтосунов, С. Хегай, А. Исакунов, Абдугани Абдурасулов
Это произведение доступно по лицензии Creative Commons «Attribution-NonCommercial» («Атрибуция — Некоммерческое использование») 4.0 Всемирная.
